Notice: Undefined index: us in /home/molsim/molsim.org/docs/sites/all/modules/ip2locale/ip2locale.module on line 505

Notice: Undefined index: us in /home/molsim/molsim.org/docs/sites/all/modules/ip2locale/ip2locale.module on line 505
Алексей Константинович Шайтан | molsim.org

Алексей Константинович Шайтан

Резюме:
application/pdf iconscience_cv_web.pdf
+7(903)741-11-76 +7(495)939-57-38 alex [at] molsim [dot] org alexeyshaytan 		Ученая степень: кандидат физико-математических наук, специальность "Высокомолекулярные соединения"
Должность: научный сотрудник

Общая информация

А.К. Шайтан работает в Группе молекулярного моделирования с 2008 года. В должности ведущего инженера кафедры биоинженерии он занимался созданием и поддержанием выскопроизводительных вычислительных кластеров для задач молекулярной биоинженерии. С 2010 года он работает в должности научного сотрудника и проводит исследования в области молекулярной динамики/вычислительной квантовой химии биомолекулярных и родственных систем. А.К. Шайтан осуществляет научное руководство несколькими студентами и проводит практические занятия по молекулярному моделированию биологических систем. Область научные интересов А.К. Шайтана включает моделирования биологических мембран, мембранных белков (ионные каналы, фотоактивные белки), самоорганизацию гибридов биологических и синтетических полимеров, расчеты величин свободной энергии в молекулярной динамики, массивно параллельные расчеты, в том числе, с применением графических процессоров.

Научные интересы

  • Применение методов компьютерного моделирования (молекулярная динамика, докинг, квантовая химия) для изучения функций биологических систем: белки и их комплексы, биологические мембраны
  • Изучение влияния различных факторов на работу ионных каналов (мутации, липидный состав, взаимодействие с лигандами)
  • Изучение свойств и динамики нуклеосом, элонгационных комплексов, структуры гетерохроматина
  • Структура амилоидных фибрил, процессы формирования фибрилл, использование амилоидных фибрилл в области нанотехнологий

Проекты

Материалы

image/jpeg iconПостер с конференции FPI-9 2010 в Атланте
application/vnd.ms-powerpoint iconПрофили свободной энергии аминокислот на границе воды (презентация)

Избранные публикации

  1. К. В. Шайтан, О. С. Соколова, А. К. Шайтан, М.А. Касимова, В. Н. Новоселецкий, М. П. Кирпичников ЭФФЕКТЫ МЕЖИОННЫХ ВЗАИМОДЕЙСТВИЙ ПРИ ФУНКЦИОНИРОВАНИИ И ИНГИБИРОВАНИИ ПОТЕНЦИАЛ-ЗАВИСИМЫХ КАЛИЕВЫХ КАНАЛОВ. Вестник МГУ, сер биология, 2012, No.4, стр 17-23.
  2. M. Yolamanova, C. Meier, A. K. Shaytan, V. Vas, C. W. Bertoncini, F. Arnold, O. Zirafi, S. M. Usmani, J. Müller, D. Sauter, C. Goffinet, D. Palesch, P. Walther, N. R. Roan, H. Geiger, O. Lunov, T. Simmet, J. Bohne,H. Schrezenmeier, K. Schwarz, L. Ständker, W.-G. Forssmann, X. Salvatella, P. G. Khalatur, A. R. Khokhlov, T. Knowles, T. Weil, F. Kirchhoff, J. Münch. Peptide nanofibrils boost retroviral gene transfer and provide a rapid means for virus concentration. Nature Nanotechnology, 2013, 8, pp. 130–136, DOI: 10.1038/NNANO.2012.248
  3. Ф.С. Орехов, А.К. Шайтан, К.В. Шайтан. Расчет спектральных сдвигов мутантов бактериородопсина гибридными методами квантовой механики/молекулярной механики. Биофизика, 2012, 57, вып. 2, стр. 221–231
  4. A. K. Shaytan. Computer simulations of self-assembling nanofibers from thiophene-peptide oligomers. PHD thesis, University of Ulm, published online, 2011, URN: urn:nbn:de:bsz:289-vts-78171
  5. A. K. Shaytan, E.-K. Schillinger, E. Mena-Osteritz, S. Schmid, P. G. Khalatur, P. Bäuerle, A. R. Khokhlov. Self-organizing bioinspired oligothiophene-oligopeptide hybrids. Beilstein Journal of Nanotechnology, 2011, 2, pp 525–544, DOI: 10.3762/bjnano.2.57
  6. Alexey K. Shaytan, Eva-Kathrin Schillinger, Pavel G. Khalatur, Elena Mena-Osteritz, Jens Hentschel, Hans G. Borner, Peter Bauerle, and Alexei R. Khokhlov, Self-Assembling Nanofibers from Thiophene–Peptide Diblock Oligomers: A Combined Experimental and Computer Simulations Study // ACSNano, DOI: 10.1021/nn2011943
  7. Шайтан А. К., Халатур П. Г., Хохлов А. Р. Суперкомпьютерное конструирование биоорганических нанопроводов // Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности, Под ред. В. А. Садовничий, Г. И. Савин, В. В. Воеводин. Москва: Издательство Московского университета, 2009. С. 51–56.
  8. Shaytan A. K., Khokhlov A. R., Khalatur P. G. Large-scale atomistic simulation of a nanosized fibril formed by thiophene-peptide “molecular chimeras” // Soft Matter, 2010, 6, pp 1453—1461, DOI: 10.1039/b918562c
  9. A.K. Shaytan, V.A. Ivanov, K.V. Shaitan , A.R. Khokhlov "Free energy profiles of amino acid side chain analogs near water-vapor interface obtained via MD simulations", // Journal of Computational Chemistry, 2010, 31(1), pp 204-216, DOI:10.1002/jcc.21267
  10. Shaytan A.K, Shaitan K.V., Khokhlov A.R. “Solvent Accessible Surface Area of Amino Acid Residues in Globular Proteins: Correlation of Apparent Transfer Free Energies with Experimental Hydrophobicity Scales. // Biomacromolecules, 2009, 10 (5), pp 1224–1237, DOI: 10.1021/bm8015169
  11. Левцова О.В., Антонов М.Ю., Шайтан А.К., Оpшанcкий И.А., Николаев И.Н., Шайтан К.В. Молекулярная динамика зервамицина II и его аналогов в воде и метаноле. //Биофизика. 2009. Т. 54. № 4. С. 616-621.
  12. К.В. Шайтан, Е.В. Турлей, Д.Н. Голик, К.Б. Терешкина, О.В. Левцова, И.В. Федик, А. К. Шайтан, Аньбан Ли, М. П. Кирпичников, «Динамичексий молекулярный дизайн био- и наноструктур», Российский Химический Журнал. 2006. Т. L, No 2. С. 53–65
  13. К.В. Шайтан, Е.В. Турлей, Д.Н. Голик, К.Б. Терешкина, О.В. Левцова, И.В. Федик, А. К. Шайтан, М. П. Кирпичников, «Неравновесная молекулярная динамика наноструктур, включая биологические», Химическая Физика, 2006, том 25, №9, с. 31-48
  14. К.В. Шайтан, Е.В. Турлей, Д.Н. Голик, К.Б. Терешкина, О.В. Левцова, И.В. Федик, А. К. Шайтан, М. П. Кирпичников, «Молекулярная динамика и дизайн био- и наноструктур», Вестник биотехнологии, 2005, т.1, №1, с. 66-78